Cytadela Warszawska to jedno z największych centrów muzealnych w Polsce. W jej obrębie działają obecnie cztery instytucje muzealne:
- Muzeum Historii Polski – nowoczesna placówka prezentująca tysiącletnią historię państwa i społeczeństwa polskiego, otwarta dla zwiedzających w nowej siedzibie na Cytadeli 29 września 2023 roku.
- Muzeum Wojska Polskiego – jedno z najstarszych muzeów wojskowych w Europie, gromadzące pamiątki polskiego oręża od średniowiecza po współczesność.
- Muzeum Katyńskie – jedyne na świecie muzeum poświęcone w całości pamięci ofiar zbrodni katyńskiej, oddział Muzeum Wojska Polskiego.
- Muzeum X Pawilonu Cytadeli Warszawskiej – mieszczące się w autentycznym XIX-wiecznym budynku więzienia śledczego, miejsce pamięci polskich więźniów politycznych okresu zaborów, oddział Muzeum Niepodległości w Warszawie.
Wszystkie instytucje są zlokalizowane na Żoliborzu i razem tworzą wyjątkową przestrzeń kulturalno-historyczną, która odgrywa coraz większą rolę w życiu mieszkańców dzielnicy.